細胞・発生・進化研究室

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[最新情報] ９月２８日に公開シンポジウム「生きものの多様性の源泉を探る＜分子構造の進化から見る世界＞」を開催します。詳細はこちら

動画配信中 
[生命誌クモラボ最新情報] 小田広樹 研究員 (2021.2.20公開)
細胞の多様な状態を一気に大量に解析する技術を取り入れました！

研究員レクチャー (2020.12.19開催)「数学や物理学の視点から見る生物の形作り？」藤原基洋

[論文発表] 動物のからだの周期パターンを制御する仕組みを発見

研究員レクチャー (2020.5.16公開)「映像が語る、未知なるクモの世界」小田広樹

ラボニュース

24.9.16-17 秋山さんと藤原さんがシュペマン・マンゴルト 100 周年記念シンポジウムSelf-Oraganization in Biologyでポスター発表（フライブルク、ドイツ）
24.9.18 秋山さんがラボ日記を更新「2024年シュペーマン・マンゴールドの論文から100年」
24.9.14 動物学ひろば（長崎）に出展しました。「身近なモデル節足動物オオヒメグモ」
24.9.12 小田さんが動物学会（長崎）で発表しました。「オオヒメグモにおいて重複胚形成を解析するシステムの開発」
24.9.3 小田さんがラボ日記を更新「ドイツの学生が3日間研究室で学びました」
24.8.27 ドイツのギーセン大学から５名の学生が実験技術を習いに来ました。こちら。
24.7.17 秋山さんがラボ日記を更新「なんのモデルなのか？」
24.7.2 小田さんがラボ日記を更新「今年もシンポジウムを開催します ＠JT生命誌研究館」
24.5.31 藤原さんが退館し、理研生命機能科学研究センター (BDR) に移りました。
24.5.15 秋山さんがラボ日記を更新「久しぶりのクモ採集」
24.5.1 小田さんがラボ日記を更新「変化の真っ只中」
24.4.20 当研究室の奨励研究員の募集を始めました。研究内容などについて気軽にお問い合わせください。
24.4.16 藤原さんがラボ日記を更新「生物を研究する上で、数学や物理学の知識は重要」
24.4.2 劉景宣さんと中川恒さんがラボメンバーに加わりました。
24.2.15 秋山さんがラボ日記を更新「エネルギー貯蔵　〜クモ幼生編〜」
24.2.1 小田さんがラボ日記を更新「タンパク質研究にハマってます」
24.1.16 藤原さんがラボ日記を更新「数理モデルを構築しながらクモの胚の形作りの精巧さに驚く日々」
23.12.01 生命誌３０周年公開シンポジウムの記事、動画が公開されました。こちらへ。
23.11.01 秋山さんがラボ日記を更新「研究をしていて嬉しいと思う時」
23.10.17 小田さんがラボ日記を更新「３０周年公開シンポジウムを終えて」
23.10.04 藤原さんがラボ日記を更新「生命誌研究館創立３０周年おめでとうございます」
23.10.01 秋山さんと小田さんが生命誌３０周年公開シンポジウムで講演しました。
23.09.09 日本動物学会 (山形) の動物学ひろばに出展しました。
23.09.08 藤原さんが日本植物学会 (札幌) のシンポジウムで「節足動物の体軸形成の多様化の進化過程を探る理論研究」と題して講演しました。
23.09.07 小田さんが日本動物学会 (山形) で「オオヒメグモゲノムを基盤としたバイオインフォマティクスリソースの構築」と題して口頭発表しました。
23.07.19 秋山さんがラボ日記を更新「今、寄生虫がおもしろい！」
23.07.04 小田さんがラボ日記を更新「ナノテクに悪戦苦闘」
23.06.24 6月の生命誌の日に開催したワークショップ「生きものらしさをコンピュータで再現しよう！」の開催記録を掲載しました。こちら→
23.06.15 小田ラボ主催のワークショップ「生きものらしさをコンピュータで再現しよう！」の参加者募集を定員に達したため終了しました。当日ライブ配信いたします。詳しくはこちら→
23.06.15 藤原さんがラボ日記を更新「生物実験に使われる数理モデルのプログラム講習会」
23.06.10 小田さんが東京でレクチャー開催。６月１０日（土）「節足動物繁栄の原点をクモの研究から探る」こちら→
23.05.10 小田ラボ主催のワークショップ「生きものらしさをコンピュータで再現しよう！」の参加者募集を開始しました。先着順です。詳しくはこちら→
23.05.10 藤原さんが「生命現象を再現する数理モデル」のページを開設しました。
23.04.30 大阪大学のいちょう祭に出展しました。
23.04.01 根岸錬さんが大学院生として当研究室に加わりました。
23.03.23 秋山さんが基礎生物学研究所-プリンストン大学合同ミーティング（@プリンストン）で講演しました。
23.03.15 秋山さんがラボ日記を更新「データ解析と格闘」
23.03.01 生命誌レクチャー「寄生蜂の宿主乗っ取り大作戦」の講師の島田裕子さんにインタビューしました。詳しくはこちら。
23.03.01 小田さんがラボ日記を更新「志すきっかけは小学生のとき」
23.02.15 生命誌 研究者セミナー「発生ゲノミクスで探る脊椎動物の進化過程」の報告&研究者インタビューを掲載しました。
23.02.15 藤原さんがラボ日記を更新「節足動物門の胚の形状変化の多様性に迫る進化研究に挑戦」
23.01.20 生命誌　研究者レクチャー「発生ゲノミクスで探る脊椎動物の進化過程」開催しました。
22.11.30 秋山さんが分子生物学会 ピペットマン５０周年記念フォーラム『シングルセル解析の最前線』で講演しました。「オオヒメグモ胚のシングルセル解析　パターンの再構成が意味すること」
22.11.15 秋山さんがラボ日記を更新「日仏発生生物学会に参加して」
22.11.09 秋山さんが日仏合同発生生物学会（ストラスブール、フランス）で口頭発表しました。
22.11.01 小田さんがラボ日記を更新「モデル生物と非モデル生物の境目」
22.10.18 藤原さんがラボ日記を更新「クモの胚発生を模倣できる数理モデルの論文が出ました」
22.10.06  岩崎さんと南條さんの論文がBMC Biologyに掲載されました。詳しくはこちら。
22.10.01 丹羽将之さん（大学院D1）が小田ラボに加入しました
22.09.22「気軽に研究室訪問。研究の現場から動物の進化を考えよう！」を10月から再開いたします。詳しくはこちら。
22.09.10 小田さんが日本動物学会（早稲田）で研究発表。
22.08.12 藤原さんの論文がFrontiers in Cell and Developmental Biologyに掲載されました。"Virtural spherical-shaped multicellular platform for simulating the morphogenetic processes of spider-like body axis formaiton."
22.08.02 秋山さんがラボ日記を更新「シングルセル解析」
22.07.22 秋山さんの論文がFrontiers in Cell and Developmental Biologyに掲載されました。"Reconstruction of the global polarity of an early spider embryo by single-celland single-nucleus transcriptome analysis."
22.07.15 小田さんがラボ日記を更新「宇宙の起源、太陽系の起源、生命の起源」
22.07.01 藤原さんがラボ日記を更新「久しぶりにオンサイトでの学会に参加しました」
22.06.18 本研究室主催の生命誌レクチャー開催「皮膚のはたらきはどのように進化したのか？」松井毅先生（東京工科大）開催記録はこちら
22.06.01-03 藤原さん、赤岩さん、小田さんそれぞれが日本発生生物学会（金沢）で研究発表。
22.04.01 秋山さんがラボ日記を更新「津田梅子について」
22.03.15 小田さんがラボ日記を更新「"気軽に研究室訪問" 始めます（イベント予告）」
22.01.18 過去のラボ在籍者の活動を紹介するページを立ち上げました。岩崎佐和博士の活動を紹介しています。
21.10.01 秋山さんがラボ日記を更新「Pエレメント」
21.10.21 小田さんがオンラインセミナーVirtual Gastrulation Zoom Talks (VGZT)に招待され、講演しました。「Axis formation in spider embryos: Regulative development under the microscope」
21.10.15 小田さんがラボ日記を更新「機能選別実験がもたらすブレークスルー」
21.10.01 藤原さんがラボ日記を更新「クモの研究を始めて１年半」
21.09.30 オオヒメグモゲノムのデータベースに最新ゲノムアセンブリ(Ptep3.0)を搭載しました。
21.09.01 第９２回日本動物学会米子大会の「動物学ひろば」にオンライン出展しました。
21.07.29 小田ラボに在籍した西口茂孝さん個人のインタビュー記事がJournal of Cell Scienceに論文とともに掲載されました(こちら)。
21.07.20 Lecture slides used by Hiroki Oda in ISP2021 Osaka Univ are available from this link.
21.06.22 カドヘリンの細胞外領域を原子間力顕微鏡で可視化した西口氏との論文が出ました（こちら）。
21.06.15 秋山さんがラボ日記を更新「近況報告」
21.06.14 データベースに動画データを追加しました。こちらのページで「time-lapse movies」を選択。
21.06.01 小田さんがラボ日記を更新「今、クモが熱い」
21.05.14 藤原さんがラボ日記を更新「変わったものを観察する」
21.04.28 データベースサイトに様々なクモ種の配列を検索できるページを立ち上げました (こちら)。
21.03.26 赤岩さんが阪大院の博士後期中間報告会で発表。「オオヒメグモ胚での全遺伝子発現パターンの推定」
21.03.24 南條さん（阪大院）修士学位記授与式
21.02.20 オープンラボでラボの最新の活動を紹介。「細胞の多様な状態を一気に大量に解析する技術を取り入れました！」
21.02.20 藤原さんのレクチャーの映像を掲載（昨年１２月に開催）。
21.02.17 南條さん（阪大院）が修士論文研究を発表。「節足動物の発生におけるクロマチン動態の比較: オオヒメグモ初期胚のATACシーケンシングによる解析」
21.02.01 秋山さんがラボ日記を更新「パブリック・ジャーナル・クラブ」
21.01.19 毎日新聞夕刊に記事掲載。「クモ見つめ、夫婦２０年　生命の謎挑み、集大成の論文」
21.01.15 小田さんがラボ日記を更新。「はやぶさ２プロジェクト」から学ぶ基礎研究のひとつの形。
20.12.28 毎日新聞デジタル版に「ハエで出会いクモに向き合う研究者夫婦が迫った動物の起源」と題して研究活動が紹介されました。
20.12.19 藤原さんが「数学や物理学の視点から見る生物の形作り」と題して研究員レクチャーを行いました。報告ページはこちら。
20.12.15 藤原さんがラボ日記を更新。「Wetな生物」と「Dryな生物」を見比べる日々。
20.12.13 朝日新聞 デジタル版に「トイレにいるクモを実験動物に　何がわかるのか」と題して当研究室のオオヒメグモが紹介されました。
20.12.7 朝日新聞 夕刊「ぶらっとラボ」に当研究室が取り上げられました。
20.11.12 毎日新聞 朝刊「科学の森」に「モデル生物、新規開拓に挑む 進化の謎に迫るため」と題して当研究室のオオヒメグモが取り上げられました。
20.11.07 小田さんと秋山さんがPublic Journal Club Developmental Biologyに招待され、海外の学生とオンラインで交流しました。
20.10.19 「生物の科学 遺伝」１１月号にクモの特集が出ます。小田さんと秋山さんがそれぞれ和文総説を書いています。
20.10.17 オープンラボ企画映像を公開しました
20.09.15 秋山さんがラボ日記を更新。「論文が出ました」
20.09.11 小田さんがオンラインで行われた国際シンポジウム「Protostome functional genetics ‐ Tribolium and friends」で発表しました。
20.09.10  秋山-小田康子さんの長年取り組んできた研究がScience Advances誌に出ました→こちら
20.09.01 小田さんがラボ日記を更新「環境の変化がもたらした気付き」
20.08.17 藤原さんがラボ日記を更新「情報化社会による生物学のつながり」
20.06.20 オープンラボ企画映像を公開しました
20.06.01 朝日新聞の本日朝刊の記事「科学の扉」に私たちのカドヘリンの研究が取り上げられました
20.05.16 研究員レクチャー、オンライン公開　「映像が語る、未知なるクモの世界」小田広樹
20.05.15 小田さんがラボ日記を更新「種としての存在を感じて」
20.05.01 藤原さんがラボ日記を更新「コンピュータによる生物実験」
20.04.15 秋山さんがラボ日記を更新「２０２０年春、夜は必ず明ける」
20.04.07 Development Genes and Evolution誌にクモ特集号が出ました。小田ラボのレビュー論文も掲載。
20.04.01 藤原基洋さん（奨励研究員）、赤岩孝憲さん（大学院D1）が小田ラボに加入しました
20.03.30 研究者向けデータベースサイト内に実験手法の動画を３本アップしました
20.03.23 実験材料としてのオオヒメグモを紹介したミニレビューがEvoDevo誌に掲載されました。
20.01.16 昨年７月２０日に開催の研究員レクチャー＆ワークショップ「形づくりの最初の一歩〜クモの胚に魅せられて〜」の記録映像がアップされました。
20.01.03 データ論文がData in Brief誌に出ました。
19.12.23 研究室紹介のビデオをアップしました。
19.12.21 小田さんの研究員レクチャーがありました。「細胞をつなぐ分子構造の段階的スリム化」
19.12.16 小田さんがラボ日記を更新しました。「交接って何？」
19.12.13 鈴木賢一博士（広島大、基生研）にお越し頂きました。セミナー開催。
19.12.04 秋山さん分子生物学会（福岡）に参加。ディスカッサーを担当。
19.11.17 秋山さんの研究員レクチャーがありました。「しましまのつくりかた」
19.11.01 秋山さんがラボ日記を更新しました。「過ぎたるは•••」
19.09.14   動物学ひろばに出展しました。
19.09.11 南條稜汰さんのM1中間発表会がありました。
19.08.31 岩﨑佐和さんが５年間の研究期間を終えて退館されました。
19.07.28 逸見なつきさん（元大学院生）がDevelopmental Biology誌の論文賞を受賞し、アメリカの発生生物学会（ボストン）で招待講演を行いました。　論文はこちら→　論文の解説はこちら→　講演の内容はこちら→
19.07.27 秋山-小田康子さんがアメリカの発生生物学会（ボストン）でポスター発表を行いました。
19.05.16 秋山-小田康子さんと岩﨑佐和さんがそれぞれ日本発生生物学会で口頭発表しました。
19.05.14   エリック・ヴィーシャウス博士とトルディ・シュプバッハ博士が来館され、クモ胚の観察を楽しまれました。
19.04.11 小田広樹さんがロンドンで開催された第４回SpiderWebミーティングで講演しました。
19.04.10 小田広樹さんがケンブリッジ大学の動物学教室で講演しました。
19.04.10   名古屋南高校生物・化学部との共同研究の成果が論文になりました！ 論文はこちら→　論文の解説はこちら→
19.04.01 南條稜汰さんが大学院生として当研究室に加わりました。
19.02.15 秋山-小田康子さんがニュージーランド、クライストチャーチで開催された国際クモ学会で招待講演を行いました。
18.06.08   国際シンポジウム「Metazoan Cell-cell Junctions」を開催しました。
12.06.13   秋山―小田康子特別研究員が日本動物学会の 「平成24年度成茂動物科学振興賞」を受賞しました。

 

研究内容

[最新論文] 逸脱して進化してきた ”変わりもの” 遺伝子がクモの初期卵で大事な役割を論文一覧はこちら

[最新論文] 細胞の動きを模倣する数理モデルを構築し、コンピュータ上でクモ胚の形状変化を再現できました論文一覧はこちら

[最新論文] 卵の中の細胞をバラバラにしても、からだの軸がコンピュータで再現できてしまう不思議論文一覧はこちら

[論文] 動物の細胞をつなぐ「古い分子」を可視化論文一覧はこちら

[論文] 多様な波の振る舞いがからだの繰り返し構造を形作る論文一覧はこちら

[総説論文] モデル生物としてのオオヒメグモを世界に紹介論文一覧はこちら

クモ胚の重複胚形成誘導を再現

節足動物の縞パターン形成を定量化

オオヒメグモのゲノムを国際協力で解読

段階的短縮化で生まれた昆虫型カドヘリン

脊椎動物と昆虫で異なる細胞間接着の構造基盤

「動物学ひろば」に出展しました 

小田ラボの論文が国際学術学会誌　Developmental Biologyの論文賞に選ばれました 

エリック・ヴィーシャウス博士とトルディ・シュプバッハ博士がBRHを訪問されました（2019年5月14日）

名古屋南高校生物・化学部との共同研究の成果が論文になりました！ 

シンポジウム開催報告

受賞報告

ラボ制作の動画

■動画1

オオヒメグモの紹介
１．飼育の仕方（英語字幕）

■動画2

オオヒメグモの紹介
２．卵の産ませ方（英語字幕）

 

 

オオヒメグモのデータベース

Pt_spiderBASE (日本産オオヒメグモのデータベース)
Pt_spider Genome & Transcripts Data BASE (ドイツ産オオヒメグモのゲノムデータベース)

 

 

 

これまでの学位取得者とそのテーマ

・令和2年度 修士論文 南條稜汰

「節足動物の発生におけるクロマチン動態の比較:オオヒメグモ初期胚の ATAC シーケンシングによる解析」

 

・令和2年度 修士論文 宮下 怜

「解毒関連遺伝子に着目した狭食性鱗翅目昆虫における食草転換機構の分子生物学的解析」

 

・平成30年度 博士論文 西口茂孝

「液中原子間力顕微鏡を用いた無脊椎動物のクラシカルカドヘリンの構造進化の解析」

 

・平成25年度 修士論文 逸見なつき

「クモ胚における縞パターン形成の定量的な解析」

 

・平成24年度 修士論文 西口茂孝

「昆虫型カドヘリンにおける接着特異性決定メカニズムの解析」

 

・平成22年度 博士論文 金山真紀

「顕微注入法を用いたクモ胚の頭部体節形成機構の解析」

 

・平成21年度 博士論文 春田知洋

「DE-cadherin細胞外領域の構造と機能が果たす形態形成過程における役割」

 

・平成19年度 修士論文 金山真紀

「オオヒメグモの胚盤周縁部領域に着目した節足動物門における前方部形成機構の解析」

 

・平成18年度 修士論文 春田知洋

「DE-cadherin細胞外領域のドメイン構成の機能的意義の解析」

 

このラボから生まれた季刊「生命誌」

 

季刊「生命誌」100号
リサーチ：生命誌研究のこれまでと今

研究者は日々、何を見て、何に驚き、何を想うのか。論文には書かれない、今まさに動いている研究の日常を語りました。

季刊「生命誌」83号
フロム BRH：生きもの愛づる人びとの物語り3

研究と表現の両輪による活動を続けて20年、明確なまとまりが見えてきました。これをどのように生かし、どう展開するか。次の10年に向けて考えています。

季刊「生命誌」65号
リサーチ：「細胞のダイナミズムが生み出す左右相称の形」

オオヒメグモの初期胚で、ある遺伝子をはたらかなくしたところ背腹軸の向きを決めるクムルスが動かず尾の領域が形成されませんでした。頭尾軸、背腹軸を決めるしくみとクムルスの動きとの関わりを探ります。

季刊「生命誌」61号
クロス：「体節形成の多様さを探る二つの視点」

節足動物の多様性の基本は「体節」というくり返し構造です。遺伝子ネットワークの違いから生み出される体節形成の多様化の道筋を、数理生物学と実験生物学の共同で探ります。

季刊「生命誌」57号
from BRH：「生物の多様化を卵から見る」

クモは、ハエと同じ節足動物でありながら、卵は球体で始めは1つの放射相称軸しか見えず、脊索動物と似た体づくりをします。節足動物と脊索動物という2つの進化の道筋を、クモがつなげてくれることを期待しています。

季刊「生命誌」50号
リサーチ：「脊椎動物の脊索はクモのどこ？」

丸い卵に頭と足が生えたようなオオヒメグモの赤ちゃん。8本の足がきちんと体の両側にできるためには、丸い卵の左右を分ける中心軸が必要です。

季刊「生命誌」47号
リサーチ：「形づくりを支える分子の形の変化」

約10億年前に単細胞生物から多細胞生物が現れた時に生まれた細胞と細胞がくっつくしくみが細胞接着です。さまざまな動物がもつ接着分子の形の変化から進化を考えます。

季刊「生命誌」42号
リサーチ：「なぜ今、クモなのか？胚発生が描く進化の道すじ」

動物の多様性が形づくられてきた仕組みを理解するために私たちが選んだのがモデル生物であるハエ、そしてクモです。節足動物の共通祖先から何が保持され何が変わったのか？その糸口が見えてきました。

季刊「生命誌」39号
「飼育・採集日記」

私たちは、節足動物内での進化を調べる一つの材料にムカデを選びました。自然の生物を扱う研究は材料の入手から大変…。高槻周辺でのムカデの採集日記です。